首先说《源代码》系统的原理：
1、人的大脑可以完整记录死亡前8分钟的场景；
2、灯关闭后有余晖，人死亡后大脑也能保持8分钟的回路，这个回路类似于容器，可装入其他记忆、可编程，这就是源代码区。
如将该区比喻为一台个人电脑，则可仅保存某些指定信息，其他信息则会在重启时清空，对应本片就是肖恩能记住所有发生过的事，而其他人则没有持续的记忆。当然如果格式化源代码区，则所有信息将全部清空，肖恩也不复存在，也就是影片结尾处博士要求古德温所做的；
很多人对于最后的层次感觉有一些混乱，我在此发表一下个人观点。
纯逻辑主线：
首先影片是通过source code的手法来进行time travel.在source code中的每一段闪回都是独立的平行宇宙（二层）。由于source code是根据现实编排的，所以无论怎么改变，最后全部遇难是必然的结果。
在这些平行宇宙之上是真实世界（一层），一层中发生的事件顺序为：
1.空军在阿富汗遇难
2.列车爆炸
3.Captain被用于source code去寻找激进分子的ID
4.激进分子被警察抓捕
5.Goodwin不忍删除Capitan的记忆，破坏source code
6.Capitan在一层宇宙中死去
第二层宇宙的最后次闪回，发生事件的顺序：
1.source code尚未启用
2.由于一层宇宙中Goodwin最后一秒破坏了source code.所以8分钟后的事情完全摆脱了source code的束缚。Capitan阻止了列车爆炸，与Cristina开始了新的生活。
3.Goodwin收到Captain的message.让她照顾好以后的要去第三层宇宙的自己。
源代码：小成本软科幻人性伦理片——依然是邓肯琼斯的风格
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